(Février 5, 2024) Passionné d'observation des oiseaux, le Dr Prashanth N Suravajhala a choisi de ne pas utiliser son téléphone portable pour sauver les oiseaux des radiations. Mais c'était jusqu'à ce qu'un beau matin de 2016, son collègue principal de l'Institut de recherche scientifique Birla de Jaipur ne lui ait laissé d'autre choix que de commencer à en utiliser un immédiatement.
Alors qu'il achetait avec hésitation un instrument et commençait à utiliser le téléphone, celui-ci a finalement donné vie à son projet de rêve : le séquençage du génome du moineau domestique (passer domesticus). "Le nombre de cet oiseau a diminué dans de nombreuses zones urbaines en raison des rayonnements électromagnétiques et d'autres activités anthropiques ces derniers temps", souligne le Dr Prashanth, chercheur principal du laboratoire de génomique des systèmes à École de biotechnologie d'Amrita, Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala, en exclusivité avec Indien du monde.
Ce n’est que récemment qu’il a achevé une recherche unique en son genre sur le séquençage des moineaux domestiques. « Nous avons terminé le séquençage et l’assemblage de son génome. Nous y avons trouvé des gènes responsables des rythmes circadiens », sourit le Dr Prashanth, qui s'intéresse naturellement à l'exploration des régions connues et inconnues des génomes animal et humain. Il affirme que Passer domesticus est l'un des meilleurs modèles d'études influençant les progrès technologiques humains sur la vie et les formes de vie commensales dans les habitats humains.
Titulaire d'un doctorat en biologie des systèmes de l'Université d'Aalborg, au Danemark, le Dr Prashanth a acquis plus de huit années d'expérience postdoctorale dans quatre laboratoires réputés. L'un de ses séjours postdoctoraux s'est déroulé à Bioinformatics.Org à Boston, où il a été directeur associé entre 2008 et 14. Un autre a eu lieu au laboratoire du Dr Haruki Nakaumra, à l'Université d'Osaka, Protein Data Bank of Japan. « Ces expériences m'ont permis de sortir de ma zone de confort », raconte la femme de 45 ans. Même si ce scientifique à la voix douce a accompli un travail phénoménal dans son domaine, le mentorat des jeunes a toujours été sa priorité absolue.
Bioindices
Le Dr Prashanth a fondé Bioclues.org virtuellement en 2005 avec le soutien de certains de ses amis et collègues. « Avec plusieurs membres principaux et mentors, il s'agit désormais de la plus grande société bioinformatique d'Inde qui œuvre pour les relations mentor-mentoré à travers les secteurs verticaux Mentoring-Outreach-Research-Entrepreneurship (MORE) », informe le Dr Prashanth.
L'une des principales missions de Bioclues est d'encourager les femmes scientifiques à se lancer dans la bioinformatique, en plus de leur transmettre une compréhension complète des principaux algorithmes et outils bioinformatiques à travers des résumés interactifs, des sondages et des discussions. « Grâce à Bioclues, nous fournissons une plateforme de projets en ligne pour encadrer des étudiants diplômés, tout en reliant les interactions des étudiants dans le domaine de la biologie computationnelle », explique le Dr Prashanth, qui a reçu la médaille d'or du professeur SS Guraya en février 2023.
Entre autres aspects, Bioclues répond au besoin d'assimiler le code open source existant et de développer de nouveaux outils et serveurs Web pour la communauté des chercheurs. « Essentiellement, nous encourageons tous les chercheurs à sortir de leur zone de confort et à réfléchir. Collaborer, Converger et Consensus sont les trois C que nous visons.
Remarquablement, le Dr Prashanth a formé cinq doctorants, avec neuf autres étudiants travaillant avec lui, dont quatre ont soumis leurs thèses. "En plus de cela, trois postdoctorants se sont formés avec moi tandis que je partage une merveilleuse camaraderie scientifique avec plusieurs boursiers diplômés et de premier cycle", sourit le Dr Prashanth, qui a également fondé le CA Prostate Consortium of India (CAPCI) et le Geneticist-Clinicians Consortium of India (GCCI).
Technologies d'analyse génomique
"J'ai toujours été fasciné par les technologies émergentes d'analyse génomique, notamment la caractérisation des mécanismes de prévalence de la maladie, les thérapies basées sur le génotype, la vérification du risque de récidive de la maladie chez les patients et les signatures d'expression génétique, pour n'en nommer que quelques-unes", informe le scientifique, qui a reçu à deux reprises le prix Amrita. Prix de l'innovation et de la recherche (AIRA) pour l'excellence des publications et prix du meilleur professeur scientifique décerné par Amrita Vishwa Vidyapeetham.
D’un autre côté, il souhaitait comprendre les outils efficaces d’évaluation des risques post-diagnostic et faciliter la classification des risques, ce qui mettrait la médecine personnalisée au premier plan.
De Kothagudem
Le Dr Prashanth a eu une modeste enfance à Kothagudem, une ville charbonnière de l’ancien État d’Andhra Pradesh et maintenant du Telangana. Ses parents Ananta Sastry et Nirmala Sastry ont grandi à Delhi et ont déménagé dans le sud. « Mes parents, en particulier ma mère, ont été mon inspiration. J’ai été attiré par la biologie dès l’école, je l’ai transformée jusqu’à son apogée où j’ai établi ma fascination pour la pensée systémique et la biologie évolutionniste », explique le scientifique.
Après avoir tenté en vain une place en médecine avec un coaching de longue durée de sept mois, il convertit ses échecs pour entreprendre un doctorat. Dans la science. Alors qu'il faisait son B.Sc, il a rencontré sa future partenaire Renuka. «À l'époque, je gagnais mon argent de poche en enseignant à temps partiel», raconte le Dr Prashanth, parti au Danemark en 2004 pour son doctorat.
Un esprit brillant
C'est en 2016 que le Dr Prashanth est retourné en Inde et a créé son groupe de génomique des systèmes au Birla Institute of Scientific Research (BISR), Jaipur, dans le but de mener des recherches de qualité. « J'ai dirigé trois projets dans les domaines de la génomique systémique ou des maladies rares et de l'analyse du séquençage nouvelle génération des cancers et du diabète », informe-t-il.
Au cours des huit dernières années, il a développé un intérêt pour les longs ARN non codants chez l'homme, élucidant les mécanismes qui sous-tendent les petites interactions moléculaires grâce aux exomes cliniques. Son groupe a développé des méthodes d'intégration génomique des systèmes. Le Dr Prashanth a plus de 90 publications dans des revues à comité de lecture et a également édité trois livres. Entre avril 2022 et août 2023, il a également été co-chercheur principal pour une recherche unique en son genre sur la détection précoce, la surveillance et la prévention des maladies virales transmissibles dans la ville de Jaipur, qui était une étude épidémiologique basée sur les eaux usées.
En tant que chercheur principal du laboratoire de génomique des systèmes de l'Amrita School of Biotechnology (Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala), le Dr Prashanth étudie les interactions protéine-protéine et la biologie systémique descendante de protéines hypothétiques, en se concentrant sur les approches de séquençage de nouvelle génération pour identifier les aspects réglementaires. du génome. En dehors de cela, il a travaillé par intermittence sur l’identification des gènes candidats impliqués dans la structure de synthèse des bactéries et des virus, en particulier pour comprendre ce qui arrive aux interactions entre l’hôte et l’agent pathogène.
Le Dr Prashanth a également obtenu de nombreuses bourses d'institutions internationales réputées. En mars 2008, il a obtenu une bourse de voyage ISMB/ISCB, à Taipei, Taiwan. En juin 2008, il a obtenu une autre bourse du Recomb Fellowship de Singapour. De même, en juillet 2010, il a obtenu une bourse de la Société internationale pour la biologie computationnelle-NY Cornell Fellowship pour la biologie computationnelle de l'Université Cornell.
La pandémie
Le scientifique principal affirme que le COVID a été une bénédiction déguisée. «Pendant la période de COVID, notre groupe a constamment collaboré avec plusieurs pairs et publié des articles de qualité et captivants avec certains des meilleurs scientifiques du pays», dit-il. Parmi les scientifiques bien connus avec lesquels il a collaboré figurent le professeur Gyaneshwar Chaubey de l'Université hindoue de Banaras et le professeur Keshav Singh, tous deux experts en génétique.
Tom et Jerry
Lorsqu'il n'est pas impliqué dans ses travaux de recherche, le Dr Prashanth adore regarder Tom et Jerry, Mr Bean, et quelques films de comédie Telugu. C'est aussi un rat de bibliothèque. «J'achète un livre à chaque voyage et je finis de le lire au moment où je voyage. Je l’ai fait dans plus de 90 pays dans lesquels j’ai voyagé », sourit le scientifique dont le livre préféré est «Transcendance : Conversation entre APJ Abdul Kalam et Pramukh Swamiji» qu'il a même offert à au moins 100 personnes.
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Les réalisations du Dr Prashanth sont louables et son engagement envers la recherche scientifique servirait de source d'inspiration pour beaucoup.
Félicitations. Que Dieu vous bénisse.
un gars incroyable qui pense toujours à la recherche et au bien envers la société de différentes manières. Que Dieu le bénisse, il obtiendra un jour le prix Nobel !
Le Dr Prash a ravivé ma passion pour la recherche alors que j'étais sur le point de quitter le domaine. Sa positivité et son soutien indéfectibles m'ont amené à obtenir un poste dans une organisation réputée à l'étranger.
Merci, monsieur, pour vos conseils et votre confiance en moi.