(5 de febrero de 2024) El Dr. Prashanth N Suravajhala, un ávido observador de aves, decidió no utilizar su teléfono móvil para salvar a las aves de la radiación. Pero eso fue hasta que una hermosa mañana de 2016, cuando su colega principal en el Instituto Birla de Investigación Científica, Jaipur, no le dejó más remedio que comenzar a usar uno de inmediato.
Cuando, con dudas, compró un instrumento y comenzó a usar el teléfono, finalmente hizo realidad el proyecto de sus sueños: la secuenciación del genoma del gorrión común (Passer domesticus). "El número de esta ave ha ido disminuyendo en muchas zonas urbanas debido a las radiaciones electromagnéticas y otras actividades antropogénicas en los últimos tiempos", señala el Dr. Prashanth, investigador principal del laboratorio de Genómica de Sistemas de Escuela de Biotecnología Amrita, Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala, en exclusiva con India global.
Recientemente completó una investigación única en su tipo sobre la secuenciación de gorriones domésticos. “Terminamos la secuenciación y ensamblaje de su genoma. Encontramos en él algunos genes responsables de los ritmos circadianos”, sonríe el Dr. Prashanth, que tiene un interés inherente en explorar las regiones conocidas y desconocidas de los genomas animales y humanos. Dice que Passer domesticus es uno de los mejores modelos para estudios que influyen en los avances tecnológicos humanos sobre la vida y las formas de vida comensales en los hábitats humanos.
Doctor en Biología de Sistemas por la Universidad de Aalborg (Dinamarca), el Dr. Prashanth adquirió más de ocho años de experiencia postdoctoral en cuatro laboratorios de renombre. Una de sus estancias posdoctorales fue en Bioinformatics.Org en Boston, donde fue director asociado entre 2008 y 14. Otro fue en el laboratorio del Dr. Haruki Nakaumra, en el Banco de Datos de Proteínas de Japón de la Universidad de Osaka. “Estas experiencias me permitieron salir de mi zona de confort”, afirma este hombre de 45 años. Si bien el científico de voz suave ha realizado un trabajo fenomenal en su campo, orientar a los jóvenes siempre ha sido su principal prioridad.
Biopistas
Dr. Prashanth fundó Biopistas.org virtualmente en 2005 con el apoyo de algunos de sus amigos y colegas. "Con varios miembros principales y mentores, ahora es la sociedad de bioinformática más grande de la India que trabaja para las relaciones entre mentor y aprendiz a través de verticales de Mentoría-Extensión-Investigación-Emprendimiento (MORE)", informa el Dr. Prashanth.
Una de las misiones principales de Bioclues es alentar a las mujeres científicas a dedicarse a la bioinformática, además de impartir una comprensión completa de los principales algoritmos y herramientas bioinformáticas a través de resúmenes, encuestas y debates interactivos. "A través de Bioclues, proporcionamos una plataforma de proyectos en línea para orientar a estudiantes de posgrado, al tiempo que unimos la interacción de los estudiantes en el campo de la biología computacional", dice el Dr. Prashanth, quien recibió la Medalla de Oro del Prof. SS Guraya en febrero de 2023.
Entre otros aspectos, Bioclues satisface la necesidad de asimilar el código fuente abierto existente y desarrollar herramientas y servidores web novedosos para la comunidad investigadora. “Básicamente, animamos a todos los investigadores a salir de su zona de confort y pensar. Colaborar, converger y consenso son las tres C a las que apuntamos”.
Sorprendentemente, el Dr. Prashanth ha producido cinco becarios de doctorado, y nueve estudiantes más trabajaron con él, de los cuales cuatro presentaron sus tesis. “Además de esto, tres posdoctorados se capacitaron conmigo mientras comparto una maravillosa camaradería científica con varios becarios de posgrado y de pregrado”, sonríe el Dr. Prashanth, quien también fundó CA Prostate Consortium of India (CAPCI) y Geneticist-Clinicians Consortium of India (GCCI).
Tecnologías de ensayo genómico.
"Siempre me fascinaron las tecnologías emergentes de análisis genómico, que incluyen la caracterización de los mecanismos de prevalencia de la enfermedad, las terapias basadas en el genotipo, la comprobación del riesgo del paciente de recurrencia de la enfermedad y las firmas de expresión genética, por nombrar algunas", informa el científico, que recibió dos veces el premio Amrita. Premio Innovación e Investigación (AIRA) a la excelencia en publicaciones y Premio al Mejor Científico Docente otorgado por Amrita Vishwa Vidyapeetham.
Por otro lado, tenía interés en comprender herramientas vívidas de evaluación de riesgos posdiagnóstico y facilitar la clasificación de riesgos que pondría en primer plano la medicina personalizada.
Desde Kothagudem
El Dr. Prashanth tuvo una crianza humilde en Kothagudem, una ciudad carbonífera en el antiguo estado de Andhra Pradesh y ahora en Telangana. Sus padres, Ananta Sastry y Nirmala Sastry, se criaron en Delhi y se mudaron al sur. “Mis padres, especialmente mi madre, fueron mi inspiración. Me atrajo la biología desde la época escolar y la transformé hasta su apogeo, donde establecí mi fascinación por el pensamiento sistémico y la biología evolutiva”, dice el científico.
Después de probar suerte para obtener una plaza en Medicina con un entrenamiento a largo plazo de siete meses, en vano, convirtió sus fracasos para realizar un doctorado. en la ciencia. Mientras estudiaba su licenciatura, conoció a su futuro socio Renuka. “En aquel entonces, me ganaba el dinero dando clases a tiempo parcial”, informa el Dr. Prashanth, que se fue a Dinamarca en 2004 para realizar su doctorado.
una mente brillante
Fue en 2016 cuando el Dr. Prashanth regresó a la India y creó su grupo de Genómica de Sistemas en el Instituto Birla de Investigación Científica (BISR), Jaipur, con el objetivo de llevar a cabo una investigación de calidad. “Dirigí tres proyectos en las áreas de genómica de sistemas o enfermedades raras y análisis de secuenciación de próxima generación de cánceres y diabetes”, informa.
Durante los últimos ocho años, desarrolló un interés en los ARN largos no codificantes en humanos, dilucidando los mecanismos que sustentan las interacciones moleculares pequeñas a través de exomas clínicos. Su grupo ha desarrollado métodos para la integración genómica de sistemas. El Dr. Prashanth tiene más de 90 publicaciones en revistas revisadas por pares y también ha editado tres libros. Entre abril de 2022 y agosto de 2023, también fue coinvestigador principal de una investigación única en su tipo sobre detección temprana, vigilancia y prevención de enfermedades virales transmisibles en la ciudad de Jaipur, que fue un estudio epidemiológico basado en aguas residuales.
Como investigador principal del laboratorio de genómica de sistemas de la Escuela de Biotecnología Amrita (Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala), el Dr. Prashanth estudia las interacciones proteína-proteína y la biología de sistemas de arriba hacia abajo de proteínas hipotéticas, centrándose en enfoques de secuenciación de próxima generación para identificar aspectos regulatorios. del genoma. Aparte de esto, había trabajado de forma intermitente en la identificación de genes candidatos implicados en la estructura sintética de bacterias y virus, especialmente en la comprensión de lo que sucede con las interacciones entre el huésped y el patógeno.
El Dr. Prashanth también obtuvo bastantes becas de prestigiosas instituciones internacionales. En marzo de 2008, obtuvo una beca de viaje ISMB/ISCB, en Taipei, Taiwán. En junio de 2008, obtuvo otra beca de Recomb Fellowship, Singapur. De manera similar, en julio de 2010, obtuvo una beca de la Sociedad Internacional de Biología Computacional-NY Cornell Fellowship para la Biología Computacional de la Universidad de Cornell.
La pandemia
El científico principal dice que el COVID ha sido una bendición disfrazada. "Durante la época de COVID, nuestro grupo colaboró firmemente con varios pares y publicó algunos de los artículos fascinantes y de calidad con algunos de los mejores científicos del país", dice. Entre los científicos de renombre con los que colaboró se encuentran el profesor Gyaneshwar Chaubey de la Universidad Hindú de Banaras y el profesor Keshav Singh, ambos expertos en genética.
Tom jerry
Cuando no está involucrado en su trabajo de investigación, al Dr. Prashanth le encanta observar Tom y Jerry, Mr. Beany algunas películas de comedia en telugu. Él también es un ratón de biblioteca. “Compro un libro durante cada viaje y lo termino de leer cuando viajo. Hice esto en los más de 90 países por los que viajé”, sonríe el científico cuyo libro favorito es “Trascendencia: Conversación entre APJ Abdul Kalam y Pramukh Swamiji”que incluso regaló a al menos 100 personas.
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Los logros del Dr. Prashanth son encomiables y su compromiso con la investigación científica serviría como fuente de inspiración para muchos.
Felicitaciones. Dios te bendiga.
Un tipo increíble que siempre piensa en la investigación y la bondad para la sociedad de diferentes maneras. ¡Dios lo bendiga y algún día logre el Premio Nobel!
El Dr. Prash reavivó mi pasión por la investigación cuando estaba a punto de dejar este campo. Su inquebrantable positividad y apoyo me han llevado a conseguir un puesto en una organización acreditada en el extranjero.
Gracias, señor, por su guía y confianza en mí.