(Februari 5, 2024) Dr. Prashanth N Suravajhala, een fervent vogelaar, koos ervoor zijn mobiele telefoon niet te gebruiken om vogels tegen straling te beschermen. Maar dat was tot op een mooie ochtend in 2016, toen zijn senior collega aan het Birla Institute of Scientific Research, Jaipur, hem geen andere keus liet dan er onmiddellijk een te gaan gebruiken.
Terwijl hij aarzelend een instrument kocht en de telefoon begon te gebruiken, bracht het uiteindelijk zijn droomproject tot leven: het bepalen van het genoom van de huismus (passer domesticus). “De aantallen van deze vogel zijn de laatste tijd in veel stedelijke gebieden afgenomen als gevolg van elektromagnetische straling en andere antropogene activiteiten”, zegt dr. Prashanth, hoofdonderzoeker van het Systems Genomics-laboratorium van Amrita School voor Biotechnologie, Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala, in een exclusieve samenwerking met Wereldwijd Indiaas.
Pas onlangs voltooide hij het unieke onderzoek naar de sequentiebepaling van huismussen. “We hebben de sequencing en assemblage van het genoom voltooid. We hebben er een aantal genen in gevonden die verantwoordelijk zijn voor circadiaanse ritmes”, glimlacht dr. Prashanth, die inherente interesse heeft in het onderzoeken van de bekende onbekende gebieden in het genoom van dieren en mensen. Hij zegt dat Passer domesticus een van de beste modellen is voor studies die de menselijke technologische vooruitgang op het leven en commensale levensvormen in menselijke habitats beïnvloeden.
Dr. Prashanth behaalde een doctoraat in systeembiologie aan de Universiteit van Aalborg, Denemarken en deed vervolgens meer dan acht jaar postdoctorale ervaring op in vier gerenommeerde laboratoria. Een van de postdoctorale periodes was bij Bioinformatics.Org in Boston, waar hij tussen 2008 en 14 Associate Director was. Een andere was in het laboratorium van Dr. Haruki Nakaumra, aan de Universiteit van Osaka, Protein Data Bank of Japan. “Deze ervaringen hebben ervoor gezorgd dat ik uit mijn comfortzone kon komen”, zegt de 45-jarige. Hoewel de wetenschapper met een zachte stem fenomenaal werk heeft verricht in zijn vakgebied, is het begeleiden van jongeren altijd zijn topprioriteit geweest.
Bio aanwijzingen
Dr. Prashanth opgericht Bioclues.org vrijwel in 2005 met steun van enkele van zijn vrienden en collega's. “Met verschillende kernleden en mentoren is het nu India's grootste bio-informaticavereniging die zich inzet voor mentor-mentee-relaties via Mentoring-Outreach-Research-Entrepreneurship (MORE) verticale activiteiten”, informeert dr. Prashanth.
Een van de belangrijkste missies van Bioclues is het aanmoedigen van vrouwelijke wetenschappers om bio-informatica te gaan beoefenen, naast het geven van een volledig inzicht in de belangrijkste bio-informatica-algoritmen en -instrumenten door middel van interactieve samenvattingen, opiniepeilingen en discussies. “Via Bioclues bieden we een online projectplatform voor het begeleiden van afgestudeerde studenten, terwijl we de interactie van studenten op het gebied van computationele biologie overbruggen”, zegt dr. Prashanth, die in februari 2023 de Prof. SS Guraya Gold Medal ontving.
Bioclues komt onder meer tegemoet aan de noodzaak om bestaande open-sourcecode te assimileren en nieuwe tools en webservers voor de onderzoeksgemeenschap te ontwikkelen. “In wezen moedigen we alle onderzoekers aan om buiten hun comfortzone te komen en na te denken. Collaborate, Converge en Consensus zijn de drie C’s waar we naar streven.”
Opmerkelijk is dat Dr. Prashanth vijf PhD-fellows heeft voortgebracht, terwijl nog negen studenten met hem samenwerken, waarvan er vier hun proefschrift hebben ingediend. “Daarnaast hebben drie postdocs met mij getraind, terwijl ik een geweldige wetenschappelijke kameraadschap deel met verschillende studenten en studenten”, glimlacht dr. Prashanth, die ook het CA Prostate Consortium of India (CAPCI) en het Geneticist-Clinicians Consortium of India (GCCI) oprichtte.
Genomische testtechnologieën
“Ik was altijd gefascineerd door de opkomende genomische testtechnologieën, waaronder het karakteriseren van mechanismen van ziekteprevalentie, genotype-gedreven therapieën, het controleren van het risico van de patiënt op herhaling van de ziekte en genexpressiesignaturen, om er maar een paar te noemen”, vertelt de wetenschapper, die tweemaal de Amrita-prijs ontving. Innovation and Research Award (AIRA) voor excellentie in publicaties en Best Faculty Scientist Award van Amrita Vishwa Vidyapeetham.
Aan de andere kant had hij interesse in het begrijpen van levendige post-diagnostische risicobeoordelingsinstrumenten en het faciliteren van risicoclassificatie, waardoor gepersonaliseerde geneeskunde op de voorgrond zou komen.
Van Kothagudem
Dr. Prashanth had een bescheiden opvoeding in Kothagudem, een kolenstad in de voormalige staat Andhra Pradesh en nu in Telangana. Zijn ouders Ananta Sastry en Nirmala Sastry groeiden op in Delhi en verhuisden naar het zuiden. “Mijn ouders, vooral mijn moeder, waren mijn inspiratiebron. Ik werd vanaf mijn schooltijd in de biologie gezogen en transformeerde het naar de hoogtijdagen, waar ik mijn fascinatie voor systeemdenken en evolutionaire biologie ontwikkelde”, zegt de wetenschapper.
Nadat hij zijn geluk had beproefd voor een plek in de geneeskunde met zeven maanden durende langetermijncoaching, zette hij zijn mislukkingen tevergeefs om in een doctoraat. in de wetenschap. Tijdens zijn B.Sc ontmoette hij zijn toekomstige partner Renuka. “Destijds verdiende ik mijn zakgeld met parttime lesgeven”, vertelt dr. Prashanth, die in 2004 naar Denemarken vertrok voor zijn doctoraat.
Een briljante geest
Het was in 2016 toen dr. Prashanth terugkeerde naar India en zijn Systems Genomics-groep oprichtte aan het Birla Institute of Scientific Research (BISR), Jaipur, met als doel kwaliteitsonderzoek uit te voeren. “Ik heb drie projecten geleid op het gebied van systeemgenomica of zeldzame ziekten en de volgende generatie sequencing-analyse van kanker en diabetes”, vertelt hij.
De afgelopen acht jaar ontwikkelde hij een interesse in lange, niet-coderende RNA's bij mensen, waarmee hij de mechanismen ophelderde die ten grondslag liggen aan kleine moleculaire interacties via klinische exomen. Zijn groep heeft methoden ontwikkeld voor de genomische integratie van systemen. Dr. Prashanth heeft meer dan 90 publicaties in peer-reviewed tijdschriften en heeft ook drie boeken geredigeerd. Tussen april 2022 en augustus 2023 was hij ook co-hoofdonderzoeker voor uniek onderzoek naar vroege detectie, surveillance en preventie van overdraagbare virusziekten in de stad Jaipur, een op afvalwater gebaseerd epidemiologisch onderzoek.
Als hoofdonderzoeker van het Systems Genomics-laboratorium aan de Amrita School of Biotechnology (Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala) bestudeert Dr. Prashanth eiwit-eiwitinteracties en top-down systeembiologie van hypothetische eiwitten, met de nadruk op sequencing-benaderingen van de volgende generatie om regelgevingsaspecten te identificeren van het genoom. Daarnaast had hij af en toe gewerkt aan het identificeren van de kandidaatgenen die betrokken zijn bij het synthetische raamwerk van bacteriën en virussen, en vooral aan het begrijpen van wat er gebeurt met de interacties tussen gastheer en pathogeen.
Dr. Prashanth kreeg ook een flink aantal beurzen van gerenommeerde internationale instellingen. In maart 2008 kreeg hij een studiebeurs van de ISMB/ISCB Travel Fellowship in Taipei, Taiwan. In juni 2008 kreeg hij opnieuw een beurs van Recomb Fellowship, Singapore. Op dezelfde manier kreeg hij in juli 2010 een beurs van The International Society for Computational Biology-NY Cornell Fellowship voor Cornell University Computational Biology.
De pandemie
De senior wetenschapper zegt dat COVID een vermomde zegen is geweest. “Tijdens de COVID-tijden heeft onze groep standvastig samengewerkt met verschillende collega’s en enkele van de hoogwaardige en boeiende artikelen gepubliceerd met enkele van de beste wetenschappers van het land”, zegt hij. Tot de bekende wetenschappers met wie hij samenwerkte behoren prof. Gyaneshwar Chaubey van Banaras Hindu University, en prof. Keshav Singh, beiden experts in genetica.
Tom & Jerry
Als dr. Prashanth niet betrokken is bij zijn onderzoekswerk, kijkt hij graag Tom en Jerry, Mr. Bean, en enkele Telugu-comedyfilms. Hij is ook een boekenwurm. “Ik koop tijdens elke reis een boek en lees het uit tegen de tijd dat ik op reis ga. Ik deed dit in alle meer dan 90 landen waar ik heb gereisd”, glimlacht de wetenschapper wiens favoriete boek “Transcendentie: gesprek tussen APJ Abdul Kalam en Pramukh Swamiji'die hij zelfs aan minstens 100 mensen schonk.
- Volg Dr. Prashanth N Suravajhala op LinkedIn
De prestaties van Dr. Prashanth zijn lovenswaardig en zijn inzet voor wetenschappelijk onderzoek zou voor velen een bron van inspiratie zijn.
Gefeliciteerd. God zegene je.
geweldige kerel die altijd op verschillende manieren aan onderzoek en goedheid voor de samenleving denkt. God zegene dat hij op een dag de Nobelprijs behaalt!
Dr. Prash wakkerde mijn passie voor onderzoek weer aan toen ik op het punt stond het vakgebied te verlaten. Zijn niet aflatende positiviteit en steun hebben ertoe geleid dat ik een positie heb verworven bij een gerenommeerde organisatie in het buitenland.
Dank u, meneer, voor uw begeleiding en geloof in mij.