(Febbraio 5, 2024) Appassionato osservatore di uccelli, il dottor Prashanth N Suravajhala ha scelto di non utilizzare il suo telefono cellulare per salvare gli uccelli dalle radiazioni. Ma questo fino a quando una bella mattina del 2016, quando il suo collega senior presso il Birla Institute of Scientific Research, Jaipur, non gli ha lasciato altra scelta se non quella di iniziare a usarne uno, immediatamente.
Quando ha acquistato con esitazione uno strumento e ha iniziato a usare il telefono, alla fine ha dato vita al progetto dei suoi sogni: il sequenziamento del genoma del passero domestico (passer domesticus). "Il numero di questo uccello è diminuito negli ultimi tempi in molte aree urbane a causa delle radiazioni elettromagnetiche e di altre attività antropiche", sottolinea il dottor Prashanth, ricercatore principale del laboratorio di Systems Genomics presso Scuola di Biotecnologie Amrita, Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala, in esclusiva con Indiano globale.
Solo di recente ha completato la ricerca, unica nel suo genere, sul sequenziamento dei passeri domestici. “Abbiamo terminato il sequenziamento e l’assemblaggio del suo genoma. Abbiamo trovato in esso alcuni geni responsabili dei ritmi circadiani”, sorride il dottor Prashanth, che ha interessi intrinseci nell’esplorazione delle regioni conosciute e sconosciute nei genomi animali e umani. Dice che Passer domesticus è uno dei migliori modelli per gli studi che influenzano i progressi tecnologici umani sulla vita e sulle forme di vita commensali negli habitat umani.
Dottore di ricerca in Biologia dei sistemi presso l'Università di Aalborg, in Danimarca, il dottor Prashanth ha accumulato più di otto anni di esperienza post-dottorato in quattro rinomati laboratori. Uno dei periodi post-dottorato è stato presso Bioinformatics.Org a Boston, dove è stato direttore associato tra il 2008 e il 14. Un altro è stato presso il laboratorio del dottor Haruki Nakaumra, presso l'Università di Osaka, Protein Data Bank of Japan. "Queste esperienze mi hanno permesso di uscire dalla mia zona di comfort", dice il 45enne. Sebbene lo scienziato dalla voce pacata abbia svolto un lavoro fenomenale nel suo campo, il mentoring dei giovani è sempre stata la sua massima priorità.
Bioindizi
Fondato il dottor Prashanth Bioclues.org virtualmente nel 2005 con il supporto di alcuni dei suoi amici e colleghi. "Con diversi membri principali e mentori, ora è la più grande società di bioinformatica dell'India che lavora per le relazioni mentore-allievo attraverso verticali Mentoring-Outreach-Research-Entrepreneurship (MORE)", informa il dott. Prashanth.
Una delle missioni principali di Bioclues è incoraggiare le scienziate a dedicarsi alla bioinformatica oltre a impartire una comprensione completa dei principali algoritmi e strumenti bioinformatici attraverso riepiloghi interattivi, sondaggi e discussioni. "Attraverso Bioclues, stiamo fornendo una piattaforma di progetti online per il tutoraggio degli studenti laureati, colmando al tempo stesso l'interazione degli studenti nel campo della biologia computazionale", afferma il dott. Prashanth, a cui è stata assegnata la medaglia d'oro del Prof. SS Guraya nel febbraio 2023.
Tra gli altri aspetti, Bioclues soddisfa la necessità di assimilare il codice open source esistente e di sviluppare nuovi strumenti e server web per la comunità di ricerca. “Essenzialmente, incoraggiamo tutti i ricercatori a uscire dalla propria zona di comfort e a pensare. Collaborare, Convergere e Consenso sono le tre C a cui miriamo”.
Sorprendentemente, il dottor Prashanth ha prodotto cinque borsisti di dottorato, con altri nove studenti che hanno lavorato con lui e quattro di loro hanno presentato le loro tesi. "Oltre a questo, tre postdoc si sono formati con me mentre condivido un meraviglioso cameratismo scientifico con diversi colleghi laureati e universitari", sorride il dottor Prashanth, che ha anche fondato il CA Prostate Consortium of India (CAPCI) e il Geneticist-Clinicians Consortium of India (GCCI).
Tecnologie di analisi genomica
"Sono sempre stato affascinato dalle tecnologie emergenti dei test genomici, tra cui la caratterizzazione dei meccanismi di prevalenza della malattia, le terapie guidate dal genotipo, il controllo del rischio di recidiva della malattia e le firme dell'espressione genetica, solo per citarne alcuni", informa lo scienziato, che ha ricevuto due volte il premio Amrita Premio Innovazione e Ricerca (AIRA) per l'eccellenza nelle pubblicazioni e Premio Miglior Scienziato di Facoltà di Amrita Vishwa Vidyapeetham.
D’altro canto, era interessato a comprendere strumenti efficaci di valutazione del rischio post-diagnostico e a facilitare la classificazione del rischio che avrebbe portato alla ribalta la medicina personalizzata.
Da Kothagudem
Il dottor Prashanth ha avuto un'umile educazione da Kothagudem, una città carbonifera nell'ex stato dell'Andhra Pradesh e ora nel Telangana. I suoi genitori Ananta Sastry e Nirmala Sastry sono cresciuti a Delhi e si sono trasferiti a sud. “I miei genitori, soprattutto mia madre, sono stati la mia ispirazione. Sono stato attratto dalla biologia fin dai tempi della scuola, l’ho trasformata fino al suo periodo di massimo splendore, dove ho sviluppato la mia passione per il pensiero sistemico e la biologia evoluzionistica”, afferma lo scienziato.
Dopo aver tentato invano la fortuna per un posto in Medicina con un coaching a lungo termine durato sette mesi, ha convertito i suoi fallimenti per intraprendere un dottorato di ricerca. nella scienza. Mentre faceva la sua laurea, ha incontrato la sua futura compagna Renuka. "Allora guadagnavo la mia paghetta insegnando a tempo parziale", racconta il dottor Prashanth, che nel 2004 è partito per la Danimarca per il suo dottorato.
Una mente brillante
Era il 2016 quando il dottor Prashanth è tornato in India e ha fondato il suo gruppo di Systems Genomics presso il Birla Institute of Scientific Research (BISR), Jaipur, con l'obiettivo di svolgere ricerca di qualità. "Ho guidato tre progetti nei settori della genomica dei sistemi o delle malattie rare e dell'analisi del sequenziamento di prossima generazione di tumori e diabete", informa.
Negli ultimi otto anni, ha sviluppato un interesse per i lunghi RNA non codificanti negli esseri umani, chiarendo i meccanismi alla base delle piccole interazioni molecolari attraverso gli esomi clinici. Il suo gruppo ha sviluppato metodi per l'integrazione genomica dei sistemi. Il dottor Prashanth ha oltre 90 pubblicazioni su riviste sottoposte a revisione paritaria e ha anche curato tre libri. Tra l'aprile 2022 e l'agosto 2023, è stato anche co-investigatore principale per una ricerca unica nel suo genere sulla diagnosi precoce, la sorveglianza e la prevenzione delle malattie virali trasmissibili nella città di Jaipur, che era uno studio epidemiologico basato sulle acque reflue.
In qualità di ricercatore principale del laboratorio di Systems Genomics presso la Amrita School of Biotechnology (Amrita Vishwa Vidyapeetham, Kerala), il dottor Prashanth studia le interazioni proteina-proteina e la biologia dei sistemi top-down di ipotetiche proteine, concentrandosi su approcci di sequenziamento di nuova generazione per identificare gli aspetti regolatori del genoma. Oltre a questo, aveva lavorato a intermittenza sull'identificazione dei geni candidati coinvolti nella struttura sintetica di batteri e virus, in particolare sulla comprensione di cosa succede alle interazioni ospite e agente patogeno.
Il dottor Prashanth ha anche ottenuto numerose borse di studio da rinomate istituzioni internazionali. Nel marzo 2008, ha ottenuto una borsa di studio dalla borsa di viaggio ISMB/ISCB, a Taipei, Taiwan. Nel giugno 2008, ha ottenuto un'altra borsa di studio dalla Recomb Fellowship, Singapore. Allo stesso modo, nel luglio 2010, ha ottenuto una borsa di studio dalla International Society for Computational Biology-NY Cornell Fellowship for Cornell University Computational Biology.
La pandemia
Lo scienziato senior afferma che il COVID è stato una benedizione sotto mentite spoglie. "Durante il periodo del COVID, il nostro gruppo ha collaborato costantemente con diversi colleghi e ha pubblicato alcuni articoli avvincenti e di qualità con alcuni dei migliori scienziati del paese", afferma. Tra i noti scienziati con cui ha collaborato figurano il prof. Gyaneshwar Chaubey della Banaras Hindu University e il prof. Keshav Singh, entrambi esperti di genetica.
Tom e Jerry
Quando non è coinvolto nel suo lavoro di ricerca, il dottor Prashanth ama guardare Tom e Jerry, Signor Beane alcuni film commedia telugu. Anche lui è un topo di biblioteca. “Compro un libro durante ogni viaggio e finisco di leggerlo prima del viaggio. L’ho fatto in tutti gli oltre 90 paesi in cui ho viaggiato”, sorride lo scienziato il cui libro preferito è “Trascendenza: conversazione tra APJ Abdul Kalam e Pramukh Swamiji” che ha addirittura regalato ad almeno 100 persone.
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I risultati del Dr. Prashanth sono encomiabili e il suo impegno nella ricerca scientifica potrebbe servire da fonte di ispirazione per molti.
Congratulazioni. Dio ti benedica.
ragazzo straordinario che pensa sempre alla ricerca e al bene per la società in modi diversi. Dio lo benedica, se un giorno otterrà il Premio Nobel!
Il dottor Prash ha riacceso la mia passione per la ricerca quando ero sul punto di lasciare il campo. La sua incrollabile positività e il suo sostegno mi hanno portato ad assicurarmi una posizione presso un'organizzazione rispettabile all'estero.
Grazie, signore, per la tua guida e la tua fiducia in me.